Ved traditionelt havopdræt af laks sker der en betydelig udledning af kvælstof til havmiljøet via laksenes afføring og det foder, der ikke spises. For meget kvælstof er yderst skadeligt, fordi det skaber øget algevækst, mudderbund og tiltagende iltsvind som truer livet i havet. I et landbaseret opdræt, er disse konsekvenser ikke til stede.
I Skagen Salmon RAS-anlæg recirkuleres saltvandet i tankene og renses konstant, hvilket sikrer optimale forhold for laksene. En lille andel (<5%) sendes retur til Kattegat, men først efter 90% af al kvælstof og fosfor er fjernet. Dermed er påvirkningen af havmiljøet minimal.
I et landbaseret opdræt er der ingen risiko for, at laksene undslipper og skaber ”faunaforurening”. Dermed har opdrætsformen i RAS-anlæg ingen konsekvenser for den vilde laksebestand.